组织设计的原则是在长期的管理实践中的经验积累，应该为组织设计者所重视。
（1）任务与目标原则
进行组织设计时要首先考虑组织结构是否能够为企业的战略任务、经营目标服务，是否能够促进企业目标的实现，要使目标活动的每一项内容都能落实到具体的岗位和部门，要因事设职，因职用人，同时重视人的特点和能力。
（2）精干高效原则
组织设计要以机构最精、人员最少、管理效率最高为准则。要能够保证组织业务活动正常开展的前提下，尽可能减少管理层次、简化部门机构，并配置少而精的主管人员。坚持这个原则的优点是非常明显的，第一个优点是组织精干，反应敏捷，协调工作量小，工作效率高；第二个优点是节省人员的费用和组织的管理费用。
（3）分工与协作原则
分工是提高组织工作效率的基本手段，可以使每一个部门或个人专心从事某一方面的工作，增加熟练程度和技巧，配备专业化的仪器设备。同时，组织是一个系统，作为其子系统的各个部门不可能相互脱离而独立运行，必须相互协调才能高效率地完成各自的任务，最终实现组织的总目标，所以分工与协作是相辅相成的。在组织设计时，要按照不同专业和性质进行合理的分工，并规定各个部门之间或部门内部的协调关系和配合方法，这是提高组织运行效率的有效手段。
（4）指挥统一原则
组织中要服从统一的指挥，即组织中每一个人只能接受同一个命令。如果有两个或两个以上领导人同时指挥，则必须在下达命令之前，进行相互沟通，达成一致意见后再下达命令，以免下级无所适从。指挥统一原则排除了组织中更高级别的主管或其他部门的主管越级指挥或越权发布命令的现象，有利于组织的政令统一、高效率地贯彻执行各项决策。但是，在实践中，这一原则有时过于刻板，使组织缺乏必要的灵活性，同层次的不同部门之间的横向沟通困难，因此，在组织结构设计和沟通方式设计时应采取适当的措施予以弥补。
（5）集权与分权相平衡原则
集权与分权相平衡原则就是根据组织的实际需要来决定集权和分权的程度。集权是指组织的大部分决策权都集中在上层。分权是指将组织的决策权根据各个层次职务上的需要进行分配。集权和分权的程度完全是根据组织在不同时期、不同环境下为了完成组织目标的需要而决定的，例如，当组织的外部环境比较稳定时宜采用集权，当外部环境变化激烈时宜采用适当程度的分权；当组织规模较小时宜采用集权，当组织规模较大时宜采用适当程度的分权；集权和分权的程度没有固定的尺度，关键是组织的决策者要高瞻远瞩、审时度势，根据需要把握好这个程度。
（6）责权一致原则
责权一致原则是指在赋予每一个职务责任的同时，必须赋予这个职务自主完成任务所需的权力，权力的大小需要和责任相适应。有责无权，无法保证完成所赋予的责任和任务，有权无责将会导致权力滥用，组织赋予每一个职务的权力不能太小，也不能太大，一定要与所赋予的职责相适应，这是组织设计时必须注意的问题。
（7）稳定性与适应性相结合原则
组织设计要保障组织的稳定运行，同时还要充分考虑内外部环境，使组织结构适应于外部环境，谋求企业内外部资源的优化配置。