说明：根据我国目前的职能改革趋势，个别部门陆续已被裁撤，具体参考数据信息请参考各市政府官网。
1.连云港市人民政府办公室
地址:连云港市新浦区解放中路167号
邮编:222002
电话:（0518）5814499
传真:（0518）5814499
主要职责
负责市政府会议的准备工作，组织会议决定事项的i实施。审核或组织起草以市政府、市政府办公室名义发布的文件、电报。办理上级和各地区发送市政府的文、电。研究市政府各部门和各县、区人民政府向市政府请示的问题，提出审核处理意见。组织协调市政府有关部门的工作；负责市政府领导同志重要文稿的撰写、修改，起草全市性综合会议报告及相关的综合材料。组织处理需由市政府直接处理的突发事件和重大事故。督促、检查文件、批示的贯彻执行情况。负责两会议案、提案的办理工作。调查研究，搜集整理信息，负责市政府值班工作。负责管理市信访局、民族宗教事务局对外开放办公室和无线电管理委员会办公室。
2.连云港市人民政府外事办公室
地址连云港市新浦海连东路3号
邮编:222002
电话:（0518）5804216
传真:（0518）5804216
主要职责:
负货组织或配合接待外宾来访，负责申办本市因公出国（境）团和人员的护照签证等出境手续；管理与外国友好城市以及其它友好单位的交往活动
3.连云港市人民政府研究室
地址:连云港市新浦区解放中路167号
邮编:222002
主要职责:
组织调查研究提出专题报告。分析宏观经济形势，负责政策研究，决策咨询工作，负责参与市政府部份重要文稿的起草。搜集、管理、运用资料编发《研究与建议》和《新经济》杂志。
4.连云港市计划委员会
地址:连云港市新浦区解放中路167号
邮编:222002
电话:（0518）5801497
传真:（0518）5455833
主要职责:
国民经济与社会事业宏观计划与管理。
5.连云港市经济委员会
地址:连云港市新浦解放中路167号
邮编:222002
电话:（0518）5811517
传真:（0518）5815015
主要职责:
编制和实施全市经济发展计划，综合协调工业生产；协调和管理交通、邮电工作；负责能源工作，企业工作，推进技术进步；负责技术改造工作；协调工业企业外贸、外经、外资工作；负责机电产品进出口管理工作。连云港市经济体制改革委员会
地址:连云港市新浦解放中路167号
邮编:222002
电话:（0518）5807363
传真:（0518）5813404
研究制订市“十四五”规划和2020-2035年远景目标综合改革实施方案，负责协调改革规划方案制订和实施中的衔接配套问题；拟订企业综合配套改革政策方案，组织试点、总结经验、指导面上改革；组织推进全市流通体制改革，会同有关部门研究和推进市场改革，和试点培育，指导推进县区综合改革和农村改革；推进住房、土地使用制度以及社会分配和社会保障制度改革；加强对证券期货监督工作。
6.连云港市科学技术委员会
地址:连云港市海连东路28号
邮编:22200G
电话:（0518）5805496
传真:（0518）5802125
主要职责:
贯彻国家、省科学技术工作方针政策；组织制订全市科技发展规划、五年计划和年度计划；会同财政部门管理科技三项费用、科学事业费、科技基金；管理星火产业开发带、高新技术园区、重点科技成果、科技外事、海洋、海岛和海岸带、电子信息技术，技术市场及软科学研究等。
7.连云港市规划建设委员会
地址:连云港市新浦区解放中路167号
邮编:222002
电话:（0518）5804570
传真:（0518）5811023
主要职责:
研究制订和组织实施全市城乡规划、城市建设、工程建设村镇建设、建筑业、市政公用事业、房地产业及城市综合开发、园林绿化的发展战略和规划方案；负责市区城市建设资金的计划安排、管理和使用；编修城市总体规划、市域规划及村镇规划；负责城市规划区建设项目选址定点、用地及工程的审批工作；统一管理和规范测绘市场；负责大中型建设项方案和初步设计审批或转报；负责城市环境综合整治工作；负责城市综合开发，旧城改造及房地产综合开发企业资审工作:综合管理建设工程的招标投标、质量监怀、建设监理与造价管理工作。