根据中共南京市委办公厅宁委发[2012]13号以及南京市机构编制委员会宁编字[2004]24号、[2009]14号、南京市机构编制委员会办公室宁编办字[2013]296号、中共南京市委市级机关工委宁委机复[2013]21号文件精神，仙林大学城党工委、管委会、纪工委内设9个职能部门。

（一）办公室

负责起草、拟订大学城工委和管委会有关文件、工作报告、政策和规章制度；检查决议、决定和领导交办工作的执行、落实情况；负责对外宣传、形象策划和信息工作；负责管委会机关文档管理和公文收发、文印、机要、保密及信访工作；负责管委会机关安全保卫、会务安排和接待工作；负责管委会机关固定资产和行政事务的管理工作。

（二）规划建设处

与市有关部门共同组织编制大学城的总体规划、详细规划和控制规划，并按照有关规定履行报批手续；负责大学城总体规划、详细规划的组织实施工作；编制、实施年度基本建设计划；按照有关授权负责承办大学城市政道路、景观绿化、综合管线、投资项目等工程建设的项目立项、工程招标、开工申请、以及相关审核、审批工作；负责自建项目的施工计划下达、工程进度及预、决算审核工作；组织开展大学城工程建设的执法检查工作；负责大学城征地、拆迁和劳动力安置的有关工作；负责大学城土地公开出让标的的编制及实施过程管理。负责大学城土地公开出让的前期条件编制工作；负责大学城工程建设资料的收集、整理、立卷及各类统计报表的编制工作。

（ 三）市政管理处

负责大学城环保、交通及有关水、电、气等市政公用设施的验收和管理；负责大学城的市容、环卫、物业管理和道路、绿化、市政设施管养等工作。

（四）计划财务处

负责编制大学城经济和社会发展中长期规划、年度计划，承担开发建设的经济预测工作；负责安排大学城固定资产投资计划、项目信贷和项目融资；负责大学城财务管理和投资管理；负责大学城规划范围中市权范围各种规费和土地出让金的征收及管理。

（五）组织人事处（机关党委）

指导大学城管委会及所属单位和党的关系在大学城工委的单位的党建工作；指导大学城管委会及所属单位的精神文明建设和宣传、统战工作；承担大学城所属单位领导干部建设的有关具体工作；承担管委会机关及所属单位机构编制、人事和专业技术职称评聘等工作；负责大学城人力资源工作；负责大学城出国人员政审工作；负责大学城管委会机关党的建设的具体工作。

（六）招商局

负责地区重大项目招商。

（七）纪工委（监察室）

负责党风廉政建设和纪检监察工作。

（八）科教服务处

负责科技创新、产学研合作、科技成果孵化转化、大学生就业创业等科教服务工作；负责仙林科技城发展联盟的有关工作；协调推进驻区高校校内科技园建设。

（九）投资审计办公室

加强对大学城管委会及所属单位投资项目的审计监督，规范项目投资行为，提高资金使用效率。