作为一个完整的科学理论体系，毛泽东思想对马克思主义的独创性发展主要有以下六个方面。
一、关于新民主主义革命的理论
1.把中国资产阶级分为大资产阶级和民族资产阶级，前者是革命的对象，后者是革命的动力。
2.科学地分析了中国农民阶级的各个阶层的经济状况和对革命的态度，提出农民是无产阶级最为可靠的同盟军。
3.中国革命只能以长期的武装斗争为主要形式。中国的武装斗争是中国民主革命的主要内容，农村根据地是中国民主革命的战略基地，农村包围城市、武装夺取政权是中国革命胜利的唯一正确道路。
4.统一战线和武装斗争是战胜敌人的两个基本武器。毛泽东思想中关于新民主主义革命理论的代表性著作有:《中国社会各阶级的分析》《湖南农民运动考察报告》《星星之火可以燎原》《中国革命和中国共产党》《共产党人发刊词》《新民主主义论》《论联合政府》《目前形势和我们的任务》等。
二、关于社会主义革命的理论和社会主义建设的思想
1.提出过渡时期总路线和社会主义改造的理论，即要在一个相当长时期内逐步实现社会主义工业化，并逐步实现国家对农业、手工业和资本主义工商业的社会主义改造。
2.发展了社会主义时期人民民主专政的理论，提出了正确处理人民内部矛盾的理论，着重阐述了正确处理人民内部矛盾是社会主义国家政治生活的主题。
3.确立建设现代化社会主义国家的目标，确定“两步走”的战略目标；正确处理经济建设过程中的各种关系；走出一条适合中国国情的工业化道路；经济体制和管理制度改革的初步思考。主要涉及的著作有:《在中国共产党第七届中央委员会第二次全体会议上的报告》《论人民民主专政》《论十大关系》《在扩大的中央工作会议上的讲话》等
三、关于革命军队的建设和军事战略的思想
1.提出建设新型人民军队的思想；指出全心全意为人民服务的人民军队宗旨；人民军队建设必须坚持党的绝对领导的原则，通过思想领导、政治领导和组织领导来实现；团结我军、团结友军、团结人民、瓦解敌军和保持战斗胜利是人民军队建设的政治工作任务；严明军队纪律；加强训练，不断提高军队素质，增强战斗力。
2.提出了以人民军队为主干，依靠广大人民群众，建立农村根据地进行人民战争的思想。3.在新中国成立以后提出必须加强国防建设，建设现代化革命武装力量和发展现代化国防技术的主要指导思想。
4.提出了一系列的符合中国实际的军事战略战术思想:武装斗争是中国革命的主要形式；游击战争在武装斗争中的主要地位；战略上藐视敌人、战术上重视敌人的思想；灵活机动的战略战术思想；关于正规战争和游击战争的结合；十大军事原则等。主要涉及的著作有:《关于纠正党内错误思想》《中国革命的战略问题》《论持久战》《战争和战略问题》等
四、关于政策和策略的思想
1.指出政策和策略是党的生命，是革命政党一切行动的出发点和归宿。必须根据政治形势、阶级关系和实际情况及其变化制定党的政策，把原则性和灵活性结合起来。
2.在对敌斗争和统一战线方面提出了重要政策和策略的思想。
3.无产阶级要实现自己对同盟者的领导，必须率领被领导者向着共同的敌人作坚决斗争并取得胜利；对被领导者给予物质利益，至少不损害他们的利益，同时还给予政治教育。关于政策和策略的思想主要体现在《目前抗日统一战线中的策略问题》《论政策》《关于打退第二次反共高潮的总结》《不要四面出击》《关于帝国主义和一切反动派是不是真老虎的问题》等著作中。
五、关于思想政治工作和文化工作的理论
1.思想政治工作是经济工作和其他一切工作的生命线，要实现政治和经济的统一，政治和科技的统一，坚持又红又专的方针。
2.发展民族的、科学的、大众的文化，实现百花齐放、百家争鸣的方针，推陈出新、古为今用、洋为中用。
3.知识分子要同工农相结合，通过学习马列主义、在学习和工作实践中树立无产阶级世界观，对人民内部的思想问题，对于精神世界的问题采取讨论、说理的方法等。涉及的著作有:《青年运动的方向》《吸收知识分子》《纪念白求恩》《为人民服务》《愚公移山》等六、关于党的建设的理论
1.以毛泽东为代表的中国共产党人成功地解决了党的理论建设、思想建设、政治建设、组织建设和作风建设问题，创造性地发展马列主义建党学说。
2.特别着重强调从思想上建设党，经常注意以无产阶级思想改造和克服各种非无产阶级思想。
3.概括了理论和实践相结合，密切联系群众以及批评与自我批评相结合的三大作风，成为中国共产党区别于其他任何政党的显著标志。
4.针对党的历史上存在过的“残酷斗争、无情打击”的“左”倾错误，提出“惩前毖后、治病教人”的正确方针，强调在党内斗争中要达到既弄清思想又团结同志的目的，创造了在全党通过批评与自我批评进行马列主义思想教育的整风形式。
5.新中国成立前夕和新中国成立以后，鉴于我们党成为领导全国政权的党，毛泽东多次提出要继续保持谦虚、戒骄戒躁、艰苦奋斗的作风，警惕资产阶级思想的侵蚀，反对脱离群众的官僚主义。