1.与其他文种的区别问题。一是与请示的区别。向上行文，凡要钱、要物、要机构、要编制等问题，要用“请示”而不能使用“意见”。“意见”与“请示”的本质区别在于它向上级要的不是“人、财、物”等“硬件”，而是“政策”“办法”等“软件”。二是与指示的区别。向下行文，凡属阐明工作指导原则，不过多地讲道理、教办法时，应用“指示”而不用“意见”。三是与通知的区别。虽然也是工作中的重要问题，但不需做较多理论分析，且对下级规定性较强、要求性很具体的，应用“指示性通知”而不用“意见”。四是与函的区别。不相隶属机关之间相互行文，对涉及某一重要问题所提的见解和处理办法，如供对方参考而不需要回复时，应用“意 见”，反之，用“函”。
2.内在结构问题。意见的内在结构必须是“提出问题一分析问题一解决问题”，三个“问题”相互衔接，缺少其中任何一个“问题”，都不符合意见写作的内在结构。同时，意见所给出的解决问题、处理工作的办法和措施要观点鲜明，符合党和国家有关方针政策；又切合实际，不超出受文机关的能力范围。
3.行文语气问题。由于意见的行文方向不同，用语也截然不同。上行的意见，要使用下级对上级汇报见解、陈述办法的语气，用语婉转，注意对上级机关的尊重。如“我们考虑”“我们认为”“我们建议”“我们意见”及“请”“敬”“望”等。下行的意见，则更多使用一些带有祈使语气表示肯定或带有禁止语气以示否定的指令性语气。平行的意见，要使用平等协商的语气，多用商量、谦恭的语句，争得对方的理解和支持。