1.秘书协调的基本方法
（1）协调要经领导授权，在秘书部门的职责范围内进行。按照领导协调的全局性、层次性、科学性、权威性、超前性等特点，努力做到：①从全局出发，尽能站在领导的高度考虑问题；②按自己的职权范围办事；③讲究协调的科学性，认真细致地做好协调前期的各项准备工作，如调查研究，研究政策，讲究方式，选择最佳时机等；④要在协调中注意维护领导的威信，特别是注意依法办事，讲究协调艺术，完善协调事项的贯彻执行和督促检查手段，确保协调结果能够兑现；要加强预见性，超前或及时协调，减少“马后炮”，在被动中力争主动。
（2）在大问题上应严格按领导所定的目标要求进行。秘书既然是辅助领导进行协调，就得遵守秘书的纪律，加强请示汇报，不擅自做主，不掺杂私心杂念。涉及重要的方针政策性问题的协调，或应由领导亲自出面的，秘书都要做好信息综合、沟通联系、事务准备和有关材料工作等；并对领导考虑不周的事情及时参谋提醒。对在自己职责范围内的事务协调，则应积极主动，大胆负责，为领导分忧解难，使领导能腾出精力和时间来抓大事。
（3）必须明确重点，充分依靠和调动其他部门的智慧与力量，共同做好协调工作。由于领导工作的全面性，而协调又贯穿于一切工作之中，秘书要想辅助领导把什么问题都协调好，实际上是不可能的；而且，秘书部门自身的力量有限，也不可能事事都管。只有协助领导，调动有关部门的积极性，提出方案，适当配合。
（4）要讲究方法和艺术。不同的问题、对象、时间、场合，有不同的协调方法，不可能使用一个模式。协调艺术则是多学科知识与经验的综合运用，它同协调者的理论、政治、经验、文化修养等都有联系，需要通过学习与实践去培养。周恩来在外交事务中提出的“求同存异”原则的实践，就是协调方法与艺术的好典范。
2.秘书在做协调工作时的注意事项
秘书在做协调工作时，应摆正位置，把握分寸，谨慎从事，特别需要注意以下几点：
（1）把握好角色，不越权越位。秘书在做协调工作时，虽然是主持者，但从严格意义上说，秘书却是代表领导在做协调工作的，并不是一切都可以自行做主。如果秘书把自己误认为是决策者，必将产生角色错位。所以，机关秘书在与协调对象沟通、传达领导的指示和意见时，不能随意引申发挥，加进自以为和领导意见一致的内容。
（2）把握好方法，不以权压人。机关秘书在工作协调的过程中利用领导的影响力是十分重要的，特别是在被协调者的多方意见难以统一时，传达出领导的意见，常常就能使问题迎刃而解。但这种方法机关秘书必须慎重使用，尽可能少用。而应以平等的态度去倾听各方意见，即便是人家提出较错误的要求，也要考虑其中有无合理的因素。不能听到不同声音就给以颜色，进行打压，那必将引发对立情绪，给以后的协调工作制造障碍。如情急之下所说的“听我的还是听你的”这句话，就应该尽量少用。
（3）把握好分寸，不把简单的问题复杂化。在协调工作中，既不要把复杂的问题简单地处理，也不要把简单的问题复杂化、明白的事情神秘化。有些矛盾在未激化前，做点幕后工作就不难缓解，如果正儿八经地召开协调会，倒会使矛盾公开化，反而给解决问题增加了困难；有的秘书不敢负责，遇事宁可搞得大一点、重一点、复杂一点，“保险门外加保险锁”，结果造成了人力、物力、财力的不必要浪费；有的则是办事讲形式不讲实际，好大喜功，好做表面文章，引发了协调对象的反感；有的秘书则认为“有矛盾就应摆在桌面上”，“公事公办”，未免太过天真······其实，就协调而言，凡是涉及重大原则的事，权力或利益冲突较大的事，具有广泛群众性的事，确实需要多方听取意见，公开处理；但一般的发生在日常工作中的责、权、利不平衡的事，处理的方针则是能私下解决的就不公开解决，能会下协调的就不必开协调会；即便需要开会协调，也应选择条件具备时在宽松的环境中来召开。
（4）把握好火候，既不失时机也别急于求成。要搞好协调，时机的确十分重要。抓住有利时机，就可取得事半功倍的效果。当不同部门急需完成同一任务，工作又难以有序展开时，机关秘书及时出面理顺关系，就可一呼百应；相反，时机不成熟，十分勉强地去统一认识，统一行动，反而可能扩大矛盾，形成误解或成见。有的秘书急于完成领导交办的任务，在有关部门毫无思想准备的情况下，就让其立即做出较大牺牲，结果形成了僵持的态势；有的虽然勉强在压力下让步，但心里并不服气，于是在落实时就扯皮推诿，影响了协调结果的兑现。尽管一个秘书的协调能力不能从一两次的协调结果来判断，但协调能力毕竟只能用最后“结果”去衡量，没有结果的协调总是不成功的。机关秘书对这点一定要引起注意。