行政鉴定与司法鉴定虽然具有共同的特点，遵循共同的原则，但两者还是有本质的区别：（1）鉴定主体不同，行政鉴定是由行政机关或者其委托的鉴定机构进行，司法鉴定则是由法院或者其指定、委托的鉴定机构进行；（2）适用的程序不同，行政鉴定主要适用于行政执法的调查取证过程，而司法鉴定适用于诉讼过程中；（3）功能有所不同，行政鉴定主要用于行政执法过程中的案件事实认定，司法鉴定则主要用于诉讼过程中争议事实的认定；（4）作用的范围不同，行政鉴定只能在行政执法程序中发挥作用，司法鉴定则可对行政鉴定结果进行重新鉴定，具有最后的救济作用。