构建事业单位人力资本激励与补偿的合理机制，对于事业单位发展和人才管理具有重要的意义。
第一，有利于激励人力资本投资和人力资本发挥效率。在大幅度促进高新技术和大力发展高新技术产业时，人们大多关注着技术本身的演进，以及政府集中国家力量进行攻坚的力度，却往往忽视了其中的决定性因素，即人力资本的作用，特别是缺乏对人力资本的激励机制。从人力资本的特征来看，其具有创造无限性、监督的有限性和消耗的差异性，所以要提高人力资本开发与使用的经济效益几乎唯一有效的途径就是满足人力资本的报酬要求，即实行充分的激励制度。
第二，有利于事业单位效益最大化的实现。人力资源是事业单位的重要资源，人力资源的质量，即人力资本的构成直接决定了事业单位的核心竞争力。如何有效地激励与补偿科技人员的人力资本，调动其积极性，使人力资本发挥最大的效率，对于事业单位效益最大化有着密切的关联。最后，有利于管理人才。随着事业单位人事改革的深入，人才的流动开始加大，市场在与人力资本有关的资源配置中的积极作用。近些年来，“智力外流”在一定程度上造成事业单位人力资本的损失。事业单位如何留住人才，成为一个突出的问题。与此同时，事业单位现在的人力资本存量中，也面临着提高质量，以适应经济社会发展更高需要的问题。如果人力投资成本与收益遭到扭曲，必然影响到人力资本投资。这些都离不开建立有效的人力资本激励与补偿机制。
如何构建事业单位人力资本激励与补偿的合理机制，真正确立劳动、资本、技术和管理等生产要素按贡献参与分配的原则，完善按劳分配为主体、多种分配方式并存的分配制度是事业单位人事制度改革的关键。针对目前事业单位人力资本激励与补偿的现状，可以从以下几个方面着手构建合理的激励与补偿机制。