1.南通市人民政府
地址南通市建设路1号
邮编:226001
电话:（0513）5519401
传真:（0513）5517026
南通市人民政府办公室
地址:南通市建设路1号
邮编:226001
电话:（0513）5519401
传真（0513）5517026
主要职责
协助市政府领导审核或组织起草以市政府市政府办公室名义发布的文件、电报。办理上级机关发送市政府的文、电；督促、检查各部门和各县（市）区对上级和市政府文件、指示、决定及领导重要指示的贯彻执行情况；研究审核市政府各部门和各县（市）.区请示的问题；负责会议准备汇作，组织实施会议决定事项协助领导组织处理需由市政府直接处理的重大事项和突发事件；组织协调市政府有关部门的工作；负责省市人大、省市政协交市政府的提案办理工作；调查研究重大课题专题；搜集整理信息；负责市政府值班和市长公开电话工作；负责市政府驻外办事处归口管理。
2.南通市计划委员会
地址:南通市建设路1号
邮编:226001
电话:（0513）5512903
传真:（0513）5518407
主要职责:
责经济结构调整，规划，协调生产力布局综合协调市场体系建设；负责固定资产投资管理；负责经济运行的分析，监测；宏观协调外贸，外经、外资工作；规划，协调和管理社会发展工作。南通市经济委员会组织实施宏观调控；制订并组织实施规划和计划。
地址:南通市建设路1号
邮编:226001
电话:（0513）5519409
传真:（0513）5529698
主要职责:
参与编制国民经济计划，组织实施年度工交生产计划，对经济运行情况定期进行分析、预测和监督；编制和实施技术开发、技改、技术引进及电子计算机信息化建设近期规划和年度计划主管国防科技工业工作；推进工交企业改革，指导企业管理；实施名牌战略。
3.南通市房产管理局
地址:南通市建设路33号
邮编:226001
电话:（0513）55121725512731
传真:（0513）5529183
主要职责:
负责房屋产权产籍管理。房屋拆迁管理、物业管理及白蚁防治工作；负责房产市场管理；负责市区直管公房经营管理
4.南通市司法局
地址南通市外环西路22号
邮编:226006
电话:（0513）3512400
传真:（0513）3512400
主要职责:
制订法制宣传教育和普及法律常识规划并组织实施，指导各地、各行业的依法治理工作；管理和指导律师工作、法律顾问工作、公证机构工作和人民调解、司法助理员及乡镇（街道）法律服务工作；制订实施法学教育规划；管理和指导司法行政系统外事和涉港澳台工作，开展政府和民间的法律交流与合作；参与、协助做好对刑满释放、解除劳动教养人员的过渡性安置工作。
5.南通市工商行政管理局
地址:南通市青年西路39号
邮编:226006
电话:（0513）3534590
传真:（0513）3534580
主要职责
主管工商企业和从事生产经营活动的事业单位，社会团体及公民个人的登记注册工作；监督管理各类消费品和生产资料市场；依法监督检查市场的交易活动，维护市场秩序；依法监督管理商标、广告、经济合同，个体工商户和私营企业，规范其经营行为。
6.南通市粮食局
地址:南通市人民中路141号
邮编:226001
电话:（0513）5512323
主要职责:
编制落实粮油购销和调拨计划；组织落实国家粮食定购任务；管理粮油储备；发展粮油工业；安排使用各项粮食补贴。
7.南通港务局
地址:南通市人民西路140号
邮编:226005
电话:（0513）3513135（总机）3513068电报:3263
传真:（0513）3518230
主要职责:
南通市和苏北地区内外贸运输；长江中上游大宗散货的中转和外贸进出口运输；旅客运输。
8.南通市计划生育委员会
地址:南通市桃坞路44号
邮编:226006
电话:（0513）55192435517544
传真:（0513）5517024
主要职责:
实施计划生育法律、法规；负责人口预测，拟订人口发展规划，制定年度人口计划组织开展计生宣传教育
和干部培训；开展技术推广服务；负责统计工作和计划生育经费的使用管理。
地址:南通市人民西路96号
邮编:226005
电话:（0513）3517930
传真:（0513）3514175
主要职责:
负责对南通口岸进出口商品实施检验，办理进出口商品鉴定，对进出口商品的质量和检验工作实施监督管理
9.南通市农业机械管理局
地址:南通市姚港路13号
邮编:226006
电话:（0513）5516016
传真:（0513）5513964
主要职责:
制定农机化发展规划，拟订农机管理政策和措施负责农机管理服务、机电排灌、农机维修、农机用油、网络建设；管理农机化专项资金，监督管理系统国有资产、集体资产。
10.南通市文化局
地址:南通市青年中路81号
邮编:226006
电话:（0513）5516096
传真:（0513）5517260
主要职责:
研究制定全市文化艺术、新闻出版、版权，文物工作的政策措施和文化事业战略发展中长期规划，指导和推进文化艺术管理体制改革和人才队伍建设，综合管理图书、文博、艺术、电影、群文、文物等文化艺术事业和社会文化市场，归口管理全市中外文化交流工作。
11.南通市水利局
地址:南通市桃坞路42号
邮编:226006
电话:（0513）5518489
传真:（0513）5513521
主要职责:
统一管理水资源和河道，主管防讯防旱和水土保持工作负水利行业管理。
12.南通市人事局
地址:南通市青年西路33号
邮编:226006
电话:（0513）3516208
传真:（0513）3516208
主要职责
综合管理企事业单位管理人员、技术人员聘任（用）工作，负责机关、事业单位工作人员的宏观规划、结构调整和宏观管理，综合管理国家公务员工作，专业技术人员工作、人才工作、机关事业单位工资福利、工人技术等级考核和社会保险工作、政府奖励表及有关任免工作，负责转业军官安置工作、社会优秀人才录用工作和机关事业单位使用工勤人员的综合管理工作。
13.南通市乡镇企业管理局
地址:南通市青年西路17号
邮编:226006
电话:（0513）3516894
传真:（0513）3510680
主要职责:
制定乡镇企业发展规划，指导企业生产经营活动和体制改革；指导企业的财务会计统计、审计工作；管理乡镇企业集体资产；指导企业出口创汇和外经贸工作；规划和指导企业重大基建和技改工作；调整乡镇企业产业结构和产品结构。
14.南通市口岸管理委员会
地址:南通市建设路1号
邮编:226001
电话:（0513）5529069
传真:（0513）5529897
主要职责:
负责口岸管理工作。
14.南通市财政局
地址:南通市青年西路38号
邮编：226006
电话:（0513）3517957
传真:（0513）3517957
主要职责:
组织财政收入，分解、拨付各种款项。管理、监督社会财务、会计，支持经济和社会各项事业的发展。
15.南通市建筑工程与材料工业管理局
地址:南通市姚港路付23号
邮编:226006
电话:（0513）3529863
传真:（0513）3517443
主要职责:
负责全市建筑业与建材工业的行业管理
16.南通市水产局
地址:南通市外环西路15号
邮编:226006
电话:（0513）3516229
传真:（0513）3513625
主要职责
制订水产业发展战略，指导产业结构调整；参与管理渔业资源，行使渔业行政执法和渔政监督管理权，维护渔业水域生态环境、渔业生产秩序生产者合法权益。南通市信访局
地址:南通市建设路1号
邮编:226001
电话:（0513）55290485513583
传真:（0513）5529048
主要职责：
受理人民群众来信、来电，来访；承办上级交办转主要职责
办的信访案件；向同级，下级交办转办有关信访案件直接查处重要信访案件；协调处理跨地区、跨部门的重要信访问题征集信访信息，提供市委市政府参考；提供法律法规、政策咨询；指导全市信访工作。