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除了政府特殊性（如垄断性、非市场性等）所导致的政府效率症结外，引起这种症结的其他原因复杂多样，一般自主观和客观两个方面。从主观上看，引起政府效率症结的原因主要包括以下四种（薛全荣，2001）。第一，政府管理体制。政府管理体制是与国家政治体制、经济体制及其他社会体制相适应的政府行政管理体制，它包括政府机构的设置与政府职能的划分两大方面。政府机构是实施政府管理的主体，政府机构的设置、编制状况，比如，政府机构的设置是否符合政府管理客体和对象的要求，政府机构设置层次的繁简程度等，都会直接影响政府效率。机构设置层次过多，会增加行政报批程序，耗费更多资源，增大政府成本，导致政府效率低下；政府职能过多，同样阻碍政府效率的提高，因为政府管得过多、过死会引起市场僵化，不利于市场体制调节与运行，影响公共品供给，从而降低政府配置资源的效率。
第二，政府运行机制。这包括政府行政管理的各个过程与环节，诸如行政咨询、行政信息、行政决策、行政执行、行政反馈、行政评价、行政监督等环节的运行情况。如准确、全面的决策信息有利于形成正确的管理决策，优化决策质量，提高决策层的效率；政府管理反馈渠道畅通，有利于修正管理计划，减少失误、少走弯路，以较短的时间圆满完成既定任务，尽快实现政府效率目标；在政府运行过程中，如果令行禁止政令畅通，政府效率就高，反之，则政府效率低。
第三，政务人员素质及结构，即公务员的素质及队伍建设。政务人员是政府管理的执行者，他们的政治、业务、文化、道德、心理等方面的素质直接影响政府效率的高低。同时，政务活动并非个体行为，科学合理的人员结构有利于充分发挥公务员整体的积极性和创造性，做到人尽其才、事得其人。此外，强化对公务员队伍的奖惩、晋升、考核等方面的制度建设，有助于优化政府机制的运行质量，提高政府效率。
第四，政府管理手段与方法。采用现代科学理论和方法，诸如系统论、运筹学、控制论、信息论及计算机网络技术，能够提高政府管理的有效幅度，缩减政府机制运行环节和时间，从而减少成本、提升政府效率。
与此同时，诸多客观因素也导致了政府效率症结。首先，政府行为客观上具有垄断性。政府履行政府职能、供应公共品具有垄断性，而垄断必然排斥和限制竞争，使政府缺乏市场竞争压力和提高效率的内在动力。其次，政府提供的公共品本身具有特殊性。由政府提供的公共品具有非市场性、共享性，它无法细分、难以根据产品质量进行精确定价，因此，消费者无法根据自己的偏好选择消费，更不能拒绝消费。因为公共品生产成本是由政府通过预算提前支付的，消费者行为对公共品生产的质量和效率没有直接影响。再次政府成本与政府收益分离。由于政务活动的收入来自政府税费或社会捐赠等非价格收入，政府成本与政府收益之间缺乏必然联系政府盈亏与政务人员的报酬没有利害关系，因为政府预算盈余或政府收益不能在公务员中进行再分配，所以政府行为目标不是节约成本增加政府产出，而是追求政府规模扩张、扩大政府消费。最后，不完全信息影响。一方面，政府面对的偏好显示和偏好加总困难，使政府无法获得全面准确的信息，从而难以保证政府公共决策的科学性和经济性，影响政府资源的有效配置；另一方面，政府垄断了公共服务信息，致使居民个体或社会组织因信息缺乏无力对政府施政过程和后果的质量优劣或效半高低进行评判。